有机多孔材料具有有序的微孔结构。POF的微孔结构可以通过材料对氮气等分子作为探针的吸附行为的测试来研究。研究显示,POF一般具有尺寸分布很小的微孔结构,也侧面说明了POF结构微观尺寸上的规则性。而有序单一的微孔结构对于气体存储、小分子分离、催化剂等的担载以及主客体化学的应用和研究都有很大的意义。
有机多孔材料的内表面积很大。材料的内表面积也是通过氮气等分子作为探针来测试的,可以一定程度上衡量多孔材料吸附小分子的能力。POF材料的内表面积通常在每克1000平方米以上,高于传统的微孔材料沸石分子筛。而PAF-1的内表面积达到每克5600平方米,甚至可以和晶态微孔材料MOF中的媲美。